Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc159Q8C963 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc159Q8C963 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc159Q8C963 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc159Q8C963 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc159Q8C963 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms