Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Alx1Q8C8B0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Alx1Q8C8B0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alx1Q8C8B0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms