Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cwc22Q8C5N3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cwc22Q8C5N3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cwc22Q8C5N3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms