Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek11Q8C0Q4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek11Q8C0Q4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek11Q8C0Q4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms