Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Lmo3Q8BZL8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmo3Q8BZL8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmo3Q8BZL8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms