Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc30Q8BVF4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc30Q8BVF4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms