Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdcl3Q8BVF2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdcl3Q8BVF2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdcl3Q8BVF2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms