Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ankrd55Q8BLD6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ankrd55Q8BLD6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ankrd55Q8BLD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms