Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4dQ8BGV9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4dQ8BGV9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4dQ8BGV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4dQ8BGV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg4dQ8BGV9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg4dQ8BGV9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg4dQ8BGV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms