Protein–RNA interactions for Protein: Q80U12

Sgsm2, Small G protein signaling modulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,005 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm2Q80U12 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sgsm2Q80U12 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sgsm2Q80U12 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgsm2Q80U12 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms