Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDXQ7Z353 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDXQ7Z353 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDXQ7Z353 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.8 ms