Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clec18aQ7TSQ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clec18aQ7TSQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Clec18aQ7TSQ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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