Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmc8Q7TN58 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmc8Q7TN58 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmc8Q7TN58 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms