Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TwistnbQ78WZ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TwistnbQ78WZ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms