Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SynmQ70IV5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SynmQ70IV5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
SynmQ70IV5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
SynmQ70IV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms