Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Cnot1Q6ZQ08 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnot1Q6ZQ08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cnot1Q6ZQ08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms