Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp8b3Q6UQ17 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp8b3Q6UQ17 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms