Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc82Q6PG04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc82Q6PG04 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc82Q6PG04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms