Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prrt3Q6PE13 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prrt3Q6PE13 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prrt3Q6PE13 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms