Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ecm29Q6PDI5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ecm29Q6PDI5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ecm29Q6PDI5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms