Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND1BQ6P3S1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1BQ6P3S1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms