Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fndc3bQ6NWW9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fndc3bQ6NWW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fndc3bQ6NWW9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms