Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRNIPQ6NTE8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRNIPQ6NTE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms