Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retreg2Q6NS82 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retreg2Q6NS82 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retreg2Q6NS82 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms