Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggnbp1Q6K1E7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggnbp1Q6K1E7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ggnbp1Q6K1E7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms