Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ScapQ6GQT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ScapQ6GQT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ScapQ6GQT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms