Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx11Q6AXC6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddx11Q6AXC6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddx11Q6AXC6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms