Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rftn1Q6A0D4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rftn1Q6A0D4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rftn1Q6A0D4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms