Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp4eQ66X19 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nlrp4eQ66X19 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms