Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VclQ64727 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VclQ64727 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VclQ64727 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VclQ64727 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VclQ64727 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VclQ64727 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VclQ64727 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VclQ64727 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VclQ64727 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VclQ64727 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VclQ64727 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VclQ64727 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VclQ64727 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VclQ64727 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VclQ64727 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VclQ64727 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VclQ64727 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VclQ64727 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VclQ64727 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VclQ64727 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VclQ64727 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VclQ64727 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VclQ64727 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VclQ64727 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VclQ64727 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VclQ64727 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VclQ64727 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms