Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptpn13Q64512 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn13Q64512 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn13Q64512 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms