Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim25Q61510 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim25Q61510 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim25Q61510 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms