Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smarcd1Q61466 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarcd1Q61466 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms