Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mre11Q61216 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mre11Q61216 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mre11Q61216 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms