Protein–RNA interactions for Protein: Q61152

Ptpn18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn18Q61152 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ptpn18Q61152 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptpn18Q61152 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn18Q61152 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms