Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm1Q60636 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prdm1Q60636 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm1Q60636 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms