Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf135Q5VTT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C9orf135Q5VTT2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf135Q5VTT2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms