Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM78BQ5VT40 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM78BQ5VT40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms