Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc125Q5U465 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc125Q5U465 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms