Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53rkaQ5U452 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trp53rkaQ5U452 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trp53rkaQ5U452 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms