Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRX1

Tom1l2, TOM1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l2Q5SRX1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tom1l2Q5SRX1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tom1l2Q5SRX1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1l2Q5SRX1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms