Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNAP47Q5SQN1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNAP47Q5SQN1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms