Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc1Q5NCF2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Trappc1Q5NCF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Trappc1Q5NCF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Trappc1Q5NCF2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trappc1Q5NCF2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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