Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim58Q5NCC9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim58Q5NCC9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim58Q5NCC9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms