Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
1810065E05RikQ5NC41 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1810065E05RikQ5NC41 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1810065E05RikQ5NC41 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms