Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM47AQ5JRC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM47AQ5JRC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms