Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtl5Q5DTT4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
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Rtl5Q5DTT4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rtl5Q5DTT4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
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