Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ESCO2Q56NI9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ESCO2Q56NI9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms