Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmtc2Q56A06 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmtc2Q56A06 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmtc2Q56A06 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms