Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prpf38aQ4FK66 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf38aQ4FK66 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf38aQ4FK66 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms